Radial Distribution Function（RDF）求解代码示范（MDAnalysis）
import MDAnalysis as mda from MDAnalysis.analysis import rdf import matplotlib.pyplot as plt import ...
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”AuToFF+Packmol+Moltemplate+LAMMPS+MDAnalysis“在MSL2 Linux环境的安装与模拟案例—以求溶液中离子的RDF-OW为例
系统：windows 11 时间：20260524 1. 软件的安装 1.1 傻瓜式安装 推荐的方式，相比于详细版后续又加入了许多新特性，后面也不打算维护详细版了。傻瓜式唯一需要动手的是安装WSL-D...
Mean Square Displacement（MSD）分析代码示例（MDAnalysis）
备注：基于LAMMPS的data+strj文件+Python MDAnalysis 代码示例： import MDAnalysis as mda from MDAnalysis.analysis im...
LAMMPS in文件范例
units real # timestep 1 fs boundary p p p atom_style full bond_styl...
MD常用命令总结
Linux 多条工作排队运行（适合已确定能跑的情况，节约时间用，不然有时候半夜第一条跑完了，只能第二天早上再续，空出来很长一段时间浪费掉了~），用&&连接命令即可实现，如： mpirun -np 8 ...
TOC测试(E8-5楼 ChBE-NUS)
TOC 开气； 开TOC机器； 开电脑； 点file打开之前的，另存为； 复制已经completed的，粘贴在下面，再删除之前的； 点connet； 需要预热20分钟左右，期间点蛋糕样，点号数，放样品...
SEM测试(ChBE-NUS)
喷金，按照桌上贴着的manual来就好，喷金完成后要用无尘纸擦一下喷金机器圆柱筒的内壁； 将样品装到样品台； 确定VENT灯常亮，EVAC灯常暗；如果不，则长按VENT按键2秒，闪烁后松手，待VENT...
[教学] 膜孔径分布拟合（溶质透过法）
用膜对至少四种不带电有机物的截留率，拟合得到膜孔径分布的方法，具体过程如下： 注意，图中分子直径换算公式仅适合用于聚乙二醇（PEG）。 附件下载：excel，...
基金配图心得
声明：以下为对时间要求比较紧或者不想浪费太多时间的情况，其实更希望自己能够充分发挥自己的想象力，绘出有自己特色的东西。 一般的，最快获得灵感的地方就是别人的图了，作图前，先去找找前辈们怎么画的； 对于...
应该共同进步，而不是一起在泥沼里浑浑噩噩地度日。